Die Nummer eins in Österreich ist noch nicht geklärt. Manninger ist aber dafür ein heißer Kandidat. Eine Geschichte aus früherer Zeit: Er wurde als Englischer Meister und Cupsieger 1998 von Teamchef Herbert Prohaska nicht für den Österreichischen WM-Kader 1998 einberufen. Er absolvierte erst 1999 in einem Freundschaftsspiel gegen Schweden sein Debüt. Am 13. Oktober 2004 verletzte er sich beim Qualifikationsspiel zur Fußball-Weltmeisterschaft 2006 gegen Nordirland schwer an der Schulter und musste mehrere Monate pausieren. Erst unter Teamchef Josef Hickersberger wurde er wieder für ein Freundschaftsspiel ins Nationalteam einberufen. Das Comeback am 15. November 2006 gelang - Österreich feierte einen 4:1-Sieg gegen den WM-Teilnehmer 2006, Trinidad und Tobago. Momentan rotiert er mit dem Ex-Lauterer Jürgen Macho und Helge Payer im Tor.